Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt4B2RU40 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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