Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lcn6A2AJB9 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lcn6A2AJB9 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms