Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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