Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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