Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn22Q9D7U6 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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