Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CntrobQ8CB62 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms