Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccser1Q8C0C4 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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