Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmeff1Q6PFE7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms