Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Tuba4a-202ENSMUST00000186213 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Glp2r-201ENSMUST00000021289 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Sfmbt1-202ENSMUST00000112184 2936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ttll8-201ENSMUST00000109371 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb6-201ENSMUST00000061717 3729 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ccrl2-201ENSMUST00000111888 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Hinfp-205ENSMUST00000216508 5333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms