Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trp53i11Q4QQM4 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trp53i11Q4QQM4 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms