Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp19Q3UJD6 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms