Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ccl7Q03366 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms