Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm44753-201ENSMUST00000207739 2335 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Sfmbt1-202ENSMUST00000112184 2936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Acot11-201ENSMUST00000065253 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sh3bp1P55194 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sh3bp1P55194 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sh3bp1P55194 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sh3bp1P55194 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sh3bp1P55194 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms