Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RxraP28700 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RxraP28700 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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