Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-Eb1P04230 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms