Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
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Ccl20O89093 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ccl20O89093 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
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Ccl20O89093 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccl20O89093 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
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