Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Srp72F8VQC1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Srp72F8VQC1 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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