Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm37446-201ENSMUST00000193015 4136 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Tia1-202ENSMUST00000095753 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 1700063K16Rik-202ENSMUST00000191341 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Lonp2-203ENSMUST00000122188 2372 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Smim1-202ENSMUST00000126119 3996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ins2-202ENSMUST00000105930 583 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm8005F6YKY3 Ccnc-201ENSMUST00000065928 3484 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm8005F6YKY3 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms