Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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