Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RhojQ9ER71 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RhojQ9ER71 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms