Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Krt78-201ENSMUST00000164932 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp27Q8CEG8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms