Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc21aQ8C0S4 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ttc21aQ8C0S4 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ttc21aQ8C0S4 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ttc21aQ8C0S4 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ttc21aQ8C0S4 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc21aQ8C0S4 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms