Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms