Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ChfrQ810L3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms