Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap2lQ7TS74 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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