Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm44547-201ENSMUST00000207793 1446 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Smim4-201ENSMUST00000049732 311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Top2aQ01320 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms