Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ggta1P23336 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Ggta1P23336 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ggta1P23336 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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