Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
TtrP07309 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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TtrP07309 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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TtrP07309 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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TtrP07309 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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TtrP07309 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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TtrP07309 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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TtrP07309 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TtrP07309 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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