Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Snrp1c-ps1-201ENSMUST00000205464 474 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc8E9PWG2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 A830018L16Rik-203ENSMUST00000137824 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm14111-201ENSMUST00000119851 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc8E9PWG2 Gm8055-201ENSMUST00000099956 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms