Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Trim39Q9ESN2 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trim39Q9ESN2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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