Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cldn22Q9D7U6 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn22Q9D7U6 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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