Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Commd4Q9CQ02 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Commd4Q9CQ02 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Commd4Q9CQ02 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Commd4Q9CQ02 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Commd4Q9CQ02 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Commd4Q9CQ02 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Commd4Q9CQ02 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Commd4Q9CQ02 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Commd4Q9CQ02 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Commd4Q9CQ02 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Fhad1-203ENSMUST00000105780 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Commd4Q9CQ02 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms