Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ciao1Q99KN2 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ciao1Q99KN2 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ciao1Q99KN2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ciao1Q99KN2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms