Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hecw1Q8K4P8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hecw1Q8K4P8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hecw1Q8K4P8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hecw1Q8K4P8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hecw1Q8K4P8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Ighv2-2-201ENSMUST00000103443 352 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm14239-201ENSMUST00000116491 685 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm11493-201ENSMUST00000134567 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm16350-201ENSMUST00000162958 446 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm4398-201ENSMUST00000182698 992 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 4930455D15Rik-201ENSMUST00000181632 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Dcstamp-204ENSMUST00000227792 1367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gstm1-202ENSMUST00000126593 828 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm11959-201ENSMUST00000148655 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm28309-201ENSMUST00000136302 623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm15351-202ENSMUST00000150686 271 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Fam162b-201ENSMUST00000020064 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hecw1Q8K4P8 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms