Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ccdc38Q8CDN8 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc38Q8CDN8 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ccdc38Q8CDN8 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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