Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm15283-202ENSMUST00000221427 818 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms