Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Dsg1bQ7TSF1 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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