Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssx9Q6XAS3 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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