Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Otx2P80206 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms