Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Ctnna3-201ENSMUST00000075099 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Clec4f-201ENSMUST00000014686 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Sh3bp1P55194 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Sh3bp1P55194 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Sh3bp1P55194 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sh3bp1P55194 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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