Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RarbP22605 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RarbP22605 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RarbP22605 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RarbP22605 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RarbP22605 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RarbP22605 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RarbP22605 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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