Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gpr160-201ENSMUST00000046748 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Fam162b-201ENSMUST00000020064 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Rbm4-201ENSMUST00000164209 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Col5a3Q9JLI2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Rhox12-202ENSMUST00000115146 561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm14276-201ENSMUST00000117941 720 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gstm1-202ENSMUST00000126593 828 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm37804-201ENSMUST00000192206 547 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Col5a3Q9JLI2 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms