Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Smg9Q9DB90 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smg9Q9DB90 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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