Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms