Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Q8BGC1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGC1 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q8BGC1 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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