Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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