Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ChfrQ810L3 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms