Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Lrrc43Q3V0L5 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrrc43Q3V0L5 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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