Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms