Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Otud5Q3U2S4 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms